自治区级重点学科（2个）

微生物学、果树学

自治区级重点培育学科（1个）

作物栽培学与耕作学

兵团重点学科（4个）： 

生物化学与分子生物学、作物栽培学与耕作学、果树学、动物营养与饲料科学

校级重点建设学科（7个）：

微生物学、农业机械化工程、农业经济管理、预防兽医学、民族学、蔬菜学、农业水土工程                                           

校级重点扶持学科（6个）：

应用化学、 植物学、 植物营养学、农产品加工及储藏、动物遗传育种与繁殖、计算机应用技术